Créée aux débuts de l'association dès 1966, la revue Falco est devenue une référence sur la faune en Franche-Comté. Synthèses, articles et notes naturalistes ou encore rapport du Comité d'Homologation Régional composent chaque numéro. Si les études et observations publiées concernent souvent les oiseaux, Falco a ouvert ses portes aux autres animaux. 

Tous les numéros de Falco sont accessibles en lecture en ligne, ainsi qu'un index (classeur) de tous les numéros. 

Falco Vol. 41	Falco Vol.40	Falco Vol.39
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Falco Vol.38	Falco Vol.38 - Hors-Série. Oiseaux d'eaux et zones humides. Les actes du 42e Colloque Interrégional d’Ornithologie.	Falco Vol.37
Falco Vol.36-2	Falco Vol.36-1	Falco Vol.35-2
Falco Vol.35-1	Falco Vol.34-2	Falco Vol.34-1
Falco Vol.33-2	Falco Vol.33-1	Falco Vol.32-2
Falco Vol.32-1	Falco Vol.31-2	Falco Vol.31-1
Falco Vol.30-2	Falco Vol.30-1	Falco Vol.29-2
Falco Vol.29-1	Falco Vol.28-2	Falco Vol.28-1
Falco Vol.27-2	Falco Vol.27-1	Falco Vol.26
Falco Vol.25 (1992)	Falco Vol.24 (1991)	Falco Vol.23-2 Spécial colloque Lynx (1990)
Falco Vol.23-1 (1989)	Falco Vol.22-2 (1988)	Falco Vol.22-1 (1987)
Falco Vol.21-2 (1986)	Falco Vol.21-1 (1986)	Falco Vol.20-2 (1985)
Falco Vol.20-1 (1985)	Falco Vol.19 (1984)	Falco Vol.18 (1983)
Falco Vol.17 (1982)	Falco Vol.16 (1981)	Falco Vol.15 (1980)
Falco Vol.14 (1979)	Falco Vol.13 (1978)	Falco Vol.12 (1977)
Falco Vol.11 (1976)	Falco Vol.10 (1975)	Falco Vol.9 (1974)
Falco Vol.8 (1973)	Falco Vol.7 (1972)	Falco Vol.6 (1971)
Falco Vol.5 (1970)	Falco Vol.4 (1969)	Falco Vol.3 (1968)
Falco Vol.2 (1967)	Falco Vol.1 (1966)