Comme toute association, la LPO Franche-Comté est dirigée par un Conseil d’administration. Cette instance, animée par le Président, est composée d’un bureau et d’autres membres administrateurs.
Le CA oriente la LPO Franche-Comté et prend les grandes décisions. Le bureau, regroupant Président, Vice-Présidents, Trésorier et Secrétaire, assure la gestion du quotidien : dossiers en cours, gestion du personnel et comptabilité.
Ces deux instances se réunissent régulièrement tout au long de l’année : plus d’une fois tous les deux mois en moyenne. Suite à la dernière assemblée générale un nouveau Conseil d’administration a été élu.

Composition du Conseil d’administration et du Bureau

	Bernard Marchiset Vesoul (70)   Président marchiset.bernard@lpo.fr		Georges Lignier Mathay (25)   Vice-Président Responsable du groupe local Pays de Montbéliard
	Anne-Lise Peugeot Valentigney (25)   Vice-Présidente		Frédéric Maillot Besançon (25)   Vice-Président
	François Rey-Demaneuf Vesoul (70)   Trésorier Responsable du groupe local Vesoul		Françoise Picavet Vesoul (70)   Secrétaire
	Samuel Delon Besançon (25)		Romuald Mignot Vesoul (70)
	Patrick Pernin Mathay (25)		Nicole Bailly Vandoncourt (25)
	Régine Collet Mandeure (25)		Tanguy Collet Mandeure (25)
	Thomas Cellier Besançon (25)